Theo đánh giá của EU, các công ty và nhà đầu tư EU vẫn phải đối mặt với rào cản về thuế và phi thuế quan tại các nước ASEAN. Đàm phán Hiệp định thương mại Tự do khu vực ASEAN-EU bị ngưng lại từ năm 2009, do vấn đề của Myanmar, khi đó EU đã chuyển sang tiến hành đàm phán song phương với từng nước thành viên ASEAN. Tuy nhiên, mục tiêu cuối cùng của EU vẫn là đàm phán FTA khu vực ASEAN - EU khi ASEAN hoàn tất thành lập Cộng đồng Kinh tế ASEAN vào năm 2015.

Hiện nay, EU đã và đang tiến hành đàm phán song phương FTA với một số nước trong khu vực ASEAN, cụ thể như sau:

- Malaysia: EU và Malaysia hiện nay đang tạm dừng đàm phán để chờ kết quả của cuộc bầu cử sắp tới. Hai bên đã đi được nửa chặng đường đàm phán, tuy nhiên những vấn đề khó khăn nhất vẫn chưa được giải quyết như sở hữu trí tuệ, mua sắm chính phủ…;

- Việt Nam: Đã kết thúc vòng đàm phán thứ 3, và chủ yếu vẫn ở giai đoạn đầu trao đổi thông tin. Tuy nhiên, EC lạc quan chia sẻ khả năng có thể kết thúc đàm phán vào cuối năm 2014;

- Thái Lan: Vòng đàm phán đầu tiên đã diễn ra tại Brussels từ ngày 27/5-31/5/2013 chủ yếu tập trung vào các lĩnh vực như thương mại hàng hóa, quy tắc xuất sứ, sở hữu trí tuệ, mua sắm công, thuế quan, phát triển bền vững, bảo hộ dịch vụ và đầu tư;

- Indonesia, Philipine: Đang ở giai đoạn trao đổi tiền đàm phán (scoping exercises);

- Myanmar: Với những thay đổi tích cực trong phát triển kinh tế và xã hội Myanmar, EU đã quyết định nối lại ưu đãi thương mại GSP/EBA cho Myanmar (theo đó Myanmar sẽ được hưởng thuế suất 0% đối với tất cả các mặt hàng xuất khẩu vào EU trừ vũ khí). Các thủ tục sẽ được hoàn thành vào tháng 6/2013;

- Singapore: Đàm phán kết thúc vào tháng 12/2012. Hiện hai bên đang tiến hành rà soát pháp lý và chờ các thủ tục phê chuẩn.