20 ngày sau ngày công bố quy định trên, tức là kể từ ngày 31 tháng 10 năm 2012 Quy định trên sẽ có hiệu lực và như vậy sản phẩm Nước mắm Phú Quốc sẽ được bảo hộ tên gọi xuất xứ trên toàn bộ lãnh thổ các nước thuộc Liên minh châu Âu (EU).

Việc đăng bạ thành công tên gọi xuất xứ “Phú Quốc” tại EU cho sản phẩm Nước mắm Phú Quốc là kết quả hỗ trợ kỹ thuật của Dự án Hỗ trợ chính sách thương mại đa biên (MUTRAP) giai đoạn II và giai đoạn III cho Hội sản xuất Nước mắm Phú Quốc (Hội SXNMPQ) với sự hợp tác, giúp đỡ của Cục Sở hữu trí tuệ Việt Nam và Ủy ban nhân dân tỉnh Kiên Giang. Từ năm 2008, Dự án MUTRAP II đã cử chuyên gia giúp Hội Sản xuất nước mắm Phú Quốc tiến hành nghiên cứu lập hồ sơ đăng ký và Dự án MUTRAP III phối hợp với Thương vụ Việt Nam tại Brussels đã hoàn chỉnh bộ hồ sơ đăng ký của Hội sản xuất nước mắm Phú Quốc trình Ủy ban châu Âu.

Nước mắm Phú Quốc là sản phẩm đầu tiên của Việt Nam được bảo hộ tên gọi xuất xứ tại Liên minh châu Âu. Theo bà Nguyễn Thị Tịnh, Chủ tịch Hiệp hội Sản xuất nước mắm Phú Quốc, việc đăng bạ thành công Tên gọi xuất xứ cho Nước mắm Phú Quốc sẽ mang lại lợi ích chính đáng cho các nhà sản xuất nước mắm Phú Quốc vì sẽ kiểm soát được hàng nhái, hàng giả Nước mắm Phú Quốc khi nhập khẩu vào Liên minh Châu Âu. Vấn đề cần làm là bảo vệ và duy trì danh tiếng, uy tín của Nước mắm Phú Quốc, khai thác tốt hơn thị trường này.