- Lãnh đạo, quản lý toàn diện các hoạt động của Trung tâm theo chức năng, nhiệm vụ được Bộ trưởng Bộ Công Thương giao

- Trực tiếp theo dõi và chỉ đạo triển khai các chương trình Phòng chống bệnh đái tháo đường; Chương trình Phòng chống HIV/AIDS; ma tuý, mại dâm; Chương trình Dân số - Kế hoạch hóa gia đình và các chương trình y tế quốc gia khác theo sự phân công nhiệm vụ của Bộ.

- Làm Chủ tịch các Hội đồng: Lương; Tuyển dụng viên chức; Thi đua khen thưởng, kỷ luật và một số hội đồng khác; Làm trưởng ban chỉ đạo khác theo lĩnh vực có liên quan.

- Làm chủ đầu tư các dự án xây dựng và phát triển của Trung tâm