Tổng kim ngạch thương mại song phương giữa Việt Nam và Malaysia 3 tháng năm 2016 đạt 1.625 triệu USD, giảm 9,2% so vớí cùng kỳ năm 2015, trong đó xuất khẩu của Việt Nam sang Malaysia đạt 654 triệu USD, giảm 18,7% và nhập khẩu của Việt Nam từ Malaysia 971 triệu USD, giảm 1,4%.

Nguyên nhân xuất khẩu của Việt Nam sang Malaysia giảm do kim ngạch xuất khẩu của các mặt hàng giảm: dầu thô giảm 61% về lượng, 75% về trị giá; điện thoại các loại giảm 34% về trị giá; cao su thiên nhiên giảm 44% về lượng và 56% về trị giá.